日本消化器内視鏡学会埼玉部会は、埼玉県内の胃カメラの普及を目的として発足した胃カメラ同好会が発展解消し、昭和39年(1964年)に日本内視鏡学会埼玉部会として設立されました。埼玉県医師会の分科会の一つとして派生した学術団体です。昭和40年に第1回総会、講演会が開催され、埼玉県医師会胃癌検診医会と共催した時期もあります。日本内視鏡学会から日本消化器内視鏡学会へと改名されたのに伴い、この部会も日本消化器内視鏡学会へと名称変更されました。
埼玉県内および近隣の診療施設における医師・医療スタッフを対象に、消化器病学ならびに消化器内視鏡学の研究・発展・啓蒙を目的としており、毎年11月に学術講演会を開催しております。