主持或参加国际合作以及国家级、部局级、院级的科研课题13项，其中：国际合作课题1项，国家级课题4项，部局级课题5项、院级课题3项，两次获得奖励。

    1、1999-2003年，主持院级课题《中日本草学术的传承及日本国本草文献研究》，该课题主要研究中国本草学对日本的影响、中日两国本草学术的比较以及日本人撰写的本草著作等，本人为课题负责人。

    2、1996-2000年，三次参加日本国际交流基金课题《日本现存中国散逸古医籍的传承史研究与利用》，作为课题组主要成员，于1997年亲赴日本，参与收集回百余种国内散逸失传的古医籍。

    3、1993-1996年，参加国家自然科学基金课题《古代针灸医学学术成就的考证研究》，博士论文《日本江户时代的针灸医学》为该课题的组成部分之一，论文首次深入系统地论述日本古代针灸医学鼎盛时期的成就与特色，剖析了日本针灸与中国医学千丝万缕的联系。

    4、1994-1996年，参加国家自然科学基金课题《中医名词术语规范化译释研究》，完成针灸推拿、儿科的日文翻译10万字。

    5、1996-1998年，参加国家社会科学基金课题《出土发掘亡佚古医药典籍与中国传统文化的研究》，完成论文和译文5万字。

    6、1998年至今，参加国务院课题《中华大典?医药卫生典》，任《人物典制》分册主编及分课题组长。现已从本草著作、非本草著作、地方志及国外古医籍中筛选出约10万字的文献资料。

    7、1994-1996年，参加卫生部课题《中国医学通史》，完成《文物图谱卷》日文翻译10万字，由人民卫生出版社出版。

    8、1997-2000年，参加国家中医管理局课题《日本现存中国散佚古医籍的研究》，整理研究《荩斋医要》、《医门秘旨》两部医书，于2002年由人民卫生出版社。

    9、2000年起，参加中医管理局课题《常用中药效用的形成演变及相关文献的研究》，任分课题组长，承担日本的本草文献中的中药效用形成与演变的研究。

    10、1999-2000年，参加国家新闻出版署课题《中医名医名术大典》，撰写书稿10万字，已交中国中医药出版社。

    11、1996-1999年，参加中国中医研究院课题《考察当前流散海外中医药善本古籍及其回收途径的研究》，作为课题组主要成员，亲赴日本收集回百余种国外藏书目录资料。

    12、1999年至今，参加中国中医研究院课题《海外中医古籍联合目录》，意在研究海外保存中医古籍的藏处、版本、保存现状、查阅途径等，现在正参加编制数据库的工作。

    13、2001年至2003年，参加科技部课题《国内失传中医善本古医籍的抢救回归与发掘研究》，赴日本及欧洲国家收集回善本中医古籍154部，约4万余页，同时校点整理回归中医古籍8部。