これについては「TS Factory」に記載されているので詳しくは述べません（要は，こことここを照らし合わせて，対応するピン同士を繋ぐケーブルを作る訳です）が，少しだけ追加事項を．
ハードディスクの太い4ピン（こちらの図のA〜Dの事です）の配線を忘れないで下さい．これらをロジック側の内蔵SCSIコネクタのGND，+5V，+12Vに繋がないとディスクは動きません．

これは私の自作ケーブルです．
完成品はこんな感じです．