| 参画研究所による共同利用・共同研究拠点（13拠点） |
- 北海道大学遺伝子病制御研究所（細菌やウイルスの持続性感染により発生する感染癌の先端的研究拠点）
- 東北大学加齢医学研究所（加齢医学研究拠点）
- 東京大学医科学研究所（基礎・応用医科学の推進と先端医療の実現を目指した医科学共同研究拠点）
- 東京医科歯科大学難治疾患研究所（難治疾患共同研究拠点）
- 群馬大学生態調節研究所（内分泌・代謝学共同研究拠点）
- 金沢大学がん進展制御研究所（がんの転移・薬剤耐性に関わる先導的共同研究拠点）
- 京都大学ウイルス・再生医科学研究所（ウイルス感染症・生命科学先端融合的共同研究拠点）
- 京都大学ウイルス・再生医科学研究所（再生医学・再生医療の先端融合的共同研究拠点）
- 大阪大学微生物病研究所（微生物病共同研究拠点）
- 大阪大学蛋白質研究所（蛋白質研究共同利用・共同研究拠点）
- 徳島大学先端酵素学研究所（酵素学研究拠点）
- 九州大学生体防御医学研究所（多階層生体防御システム研究拠点）
- 熊本大学発生医学研究所（発生医学の共同研究拠点）
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